1 września 1997 roku z inicjatywy Dolnośląskiego Stowarzyszenia na Rzecz Autyzmu powstała pierwsza publiczna Szkoła Podstawowa dla uczniów z autyzmem. Placówka została zorganizowana jako filia Szkoły Podstawowej Specjalnej Nr 8 we Wrocławiu. Filia otrzymała odrębny budynek przy ul. Budziszyńskiej 65. Z dniem 1 września 2000r. filia stała się samodzielną placówką – Szkołą Podstawową Nr 102. 1 września 2002 powołano Zespół Szkół Specjalnych Nr 28 dla Uczniów z Autyzmem, w skład którego weszły Szkoła Podstawowa Nr 102 i Gimnazjum Nr 58. We wrześniu 2004 połączono Zespół Szkół Nr 28 ze Specjalnym Ośrodkiem Szkolno –Wychowawczym Nr 7 i powołano Zespół Placówek Oświatowych Nr 2 z siedzibą przy ul. Głogowskiej 30 we Wrocławiu. 1 września2007r.utworzono Szkołę Specjalną Przysposabiającą do Pracy Nr 2 dla Uczniów zAutyzmem, która weszła wskład Zespołu Placówek Oświatowych Nr 2 we Wrocławiu.1 września 2016r. Szkoła Podstawowa Nr 102 oraz Szkoła Przysposabiająca do Pracy Nr 2 rozpoczęły funkcjonowanie jako Zespół Szkół Nr 16.